Si es bien cierto que al usar tu memoria portátil en varios ordenadores, se corre el riesgo de introducir en el algún virus, o lo que es mas temible hoy en día un spyware. La única manera de solventar el problema es que tu ordenador este vacunado con un buen programa de antivirus, cuestión de que tan pronto lo lea, le haga un escaneo general.

Saludos

Néstor